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科學(xué)家發(fā)表迄今最大自閉癥基因組研究

2015-01-28 20:54 閱讀:710 來源:生物360 作者:老* 責(zé)任編輯:老者
[導(dǎo)讀] 由自閉癥研究機(jī)構(gòu)Autism Speaks資助、有史以來規(guī)模最大的自閉癥基因組研究表明,這種疾病的遺傳學(xué)基礎(chǔ),甚至比我們以前認(rèn)為的更為復(fù)雜

    由自閉癥研究機(jī)構(gòu)Autism Speaks資助、有史以來規(guī)模最大的自閉癥基因組研究表明,這種疾病的遺傳學(xué)基礎(chǔ),甚至比我們以前認(rèn)為的更為復(fù)雜:大多數(shù)患有自閉癥譜系障礙(ASD)的兄弟姐妹,有著不同的自閉癥相關(guān)基因。這項(xiàng)研究由Autism Speaks MSSNG項(xiàng)目主任帶領(lǐng),以封面文章的形式發(fā)表在1月26日的《自然-醫(yī)學(xué)》(Nature Medicine)。

    同時,這項(xiàng)研究的數(shù)據(jù)成為Google Cloud Platform 上Autism Speaks MSSNG門戶第一次上傳的大約1000個自閉癥基因組的一部分。Autism Speaks正在使已識別的數(shù)據(jù)為全球研究公開可用,以加速我們對自閉癥的了解和個性化治療的發(fā)展。延伸閱讀:Nature兩項(xiàng)研究發(fā)現(xiàn)幾十個自閉癥基因。

    本研究負(fù)責(zé)人Stephen Scherer說:“這是歷史性的一天,它首次標(biāo)志著自閉癥全基因組序列可供MSSNG開放科學(xué)數(shù)據(jù)庫的研究使用。這是未來開放獲取基因組將帶來許多發(fā)育和醫(yī)學(xué)疾病個性化治療的范例。除了領(lǐng)先的Autism Speaks' MSSNG program,Scherer還指導(dǎo)多倫多兒童醫(yī)院應(yīng)用基因組中心和多倫多大學(xué)McLaughlin中心的相關(guān)研究。”

    本文共同作者、Autism Speaks 首席科學(xué)官Robert Ring說:“通過使用計(jì)算機(jī)云,使數(shù)據(jù)像這樣供世界各地的研究人員公開訪問,我們正在以一種以前沒用過的方式,打破壁壘。一直以來,我們Autism Speaks的目標(biāo)是,加速科學(xué)發(fā)現(xiàn),最終提高世界各地自閉癥患者的個人生活質(zhì)量。”

    總的來說,MSSNG project旨在使10,000個自閉癥基因供科學(xué)研究使用,作為一種最先進(jìn)工具的“工具箱”來幫助分析。

    自閉癥驚人的多樣性

    在這項(xiàng)新研究中,Scherer博士的研究小組在85個家庭中測定了340個全基因組,每個家庭都有受自閉癥影響的兒童。大部分兄弟姐妹在已知引起自閉癥的基因變異上沒有重疊。他們發(fā)現(xiàn),共有相同自閉癥相關(guān)基因變化的同胞對數(shù)還不到三分之一(31%)。

    這些研究結(jié)果對長期持有的假設(shè)提出了挑戰(zhàn)。因?yàn)樽蚤]癥常常是家族性的,專家們認(rèn)為,患有該疾病的兄弟姐妹從其父母那里遺傳了相同的自閉癥易感基因?,F(xiàn)在看來,這可能不是真的。Scherer博士說:“我們知道,自閉癥有很多差異,但是我們最近的研究結(jié)果堅(jiān)定地明確了這一點(diǎn)。我們相信,每一個自閉癥患兒都像一片雪花,是獨(dú)一無二的。”

    Scherer博士補(bǔ)充說:“這意味著,我們不應(yīng)該只尋找疑似自閉癥風(fēng)險基因,這通常是在基因診斷檢測中完成的。確定如何最好地使用個性化自閉癥治療中的遺傳因素知識,就需要全面評估每一個人的基因組。”全基因組測序遠(yuǎn)遠(yuǎn)超過了傳統(tǒng)的遺傳測試,來分析一個人完整的DNA序列。

    在參與研究的42%的家庭中,發(fā)現(xiàn)了已知的自閉癥風(fēng)險基因。Scherer博士說:“這可能有助于解釋為什么自閉癥出現(xiàn)在他們的孩子當(dāng)中,或者為相關(guān)醫(yī)學(xué)疾病提供了新的見解。”在2013年一項(xiàng)試點(diǎn)基因組測序研究中,Scherer博士的研究小組在超過32%的受試家庭中發(fā)現(xiàn)了自閉癥相關(guān)基因。這項(xiàng)研究為一些家庭提供了重要的醫(yī)學(xué)信息。

    原文檢索:

    Whole-genome sequencing of quartet families with autism spectrum disorder


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