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新一代DNA測(cè)序技術(shù)助力癌癥抗原篩查

2013-06-27 11:00 閱讀:1699 來源:生物360 作者:網(wǎng)* 責(zé)任編輯:網(wǎng)絡(luò)
[導(dǎo)讀] 日前,美國國家癌癥研究所等機(jī)構(gòu)的科學(xué)家們開發(fā)出了一種新的流線化方法,可快速鑒別出黑色素瘤中可被腫瘤浸潤淋巴細(xì)胞識(shí)別的獨(dú)特突變抗原。過去的研究證實(shí)腫瘤浸潤淋巴細(xì)胞能夠減少癌癥病變,這些獨(dú)特的蛋白小片段是腫瘤浸潤淋巴細(xì)胞的識(shí)別靶標(biāo)。

    日前,美國國家癌癥研究所等機(jī)構(gòu)的科學(xué)家們開發(fā)出了一種新的流線化方法,可快速鑒別出黑色素瘤中可被腫瘤浸潤淋巴細(xì)胞識(shí)別的獨(dú)特突變抗原。過去的研究證實(shí)腫瘤浸潤淋巴細(xì)胞能夠減少癌癥病變,這些獨(dú)特的蛋白小片段是腫瘤浸潤淋巴細(xì)胞的識(shí)別靶標(biāo)。
 


    此前的一項(xiàng) 2 期臨床試驗(yàn)顯示,70% 的黑色素瘤患者接受自體腫瘤浸潤淋巴細(xì)胞治療,可導(dǎo)致轉(zhuǎn)移病灶顯著消退。

    在這項(xiàng)最新研究中,科學(xué)家對(duì)患者過繼轉(zhuǎn)移了自身的免疫細(xì)胞,近 40% 的患者在至少 5 年的時(shí)間內(nèi)腫瘤完全消退。為了更好地了解它的作用機(jī)制,研究人員開發(fā)了一種新方法,有助于更快地篩查出這些腫瘤浸潤淋巴細(xì)胞識(shí)別的突變抗原。

    腫瘤浸潤淋巴細(xì)胞是指那些離開血流進(jìn)入到腫瘤中的白細(xì)胞。當(dāng)存在大量的腫瘤浸潤淋巴細(xì)胞時(shí),表明機(jī)體啟動(dòng)了對(duì)抗腫瘤的免疫反應(yīng)。在許多的癌癥中,研究人員均開展了相關(guān)的研究,定量這些腫瘤浸潤細(xì)胞,并將其數(shù)量與腫瘤特征和結(jié)果關(guān)聯(lián)起來。

    研究人員認(rèn)為,更好地了解腫瘤浸潤淋巴細(xì)胞誘導(dǎo)癌細(xì)胞消退的機(jī)制,將提高患者自體移植細(xì)胞治療的效力,并且有可能揭示出腫瘤生長新機(jī)制。

    研究人員指出,新技術(shù)能夠更快、更容易地鑒別出免疫系統(tǒng)T細(xì)胞識(shí)別的突變基因抗原。從前,研究人員都是通過生成以及費(fèi)力地篩查來自腫瘤的DNA庫,來完成這樣的工作。這一新篩查技術(shù)有可能還適用于在許多癌癥類型中鑒別突變抗原。

    新方法采用了新一代 DNA 測(cè)序技術(shù),挖掘全外顯子序列數(shù)據(jù),鑒別在患者中表達(dá)的突變蛋白。隨后研究人員合成出候選的突變T細(xì)胞抗原表位,并用一種主要組織相容性復(fù)合物結(jié)合算法對(duì)候 選表位進(jìn)行了評(píng)估。利用這種方法,研究人員鑒別出了在患者腫瘤細(xì)胞上表達(dá),能被腫瘤浸潤淋巴細(xì)胞識(shí)別的突變抗原。


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