由中國工程院院士、中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院腫瘤醫(yī)院分子腫瘤學(xué)國家重點實驗室詹啟敏教授研究團隊與華大基因、汕頭大學(xué)醫(yī)學(xué)院等單位的科研人員合作，通過高通量測序、比較基因組雜交芯片分析、生物學(xué)功能和臨床驗證研究，全面系統(tǒng)地揭示了食管鱗癌的遺傳突變背景，發(fā)現(xiàn)了與食管鱗癌發(fā)生發(fā)展進程和臨床預(yù)后相關(guān)的基因，為了解食管鱗癌的發(fā)病機制，尋找食管鱗癌診斷的分子標志物，確定研發(fā)臨床治療的藥物靶點以及制定有效的治療方案提供了理論和實驗依據(jù)。研究論文2014年3月16日在線發(fā)表于《自然》(Nature)雜志。

    詹院士研究團隊利用基因組學(xué)、生物信息學(xué)、分子生物學(xué)、臨床病理學(xué)理論和技術(shù)，結(jié)合我國食管鱗癌患者樣本和臨床信息，開展了全面、深入的研究。

    研究人員發(fā)現(xiàn)了8個與食管鱗癌發(fā)生相關(guān)的重要的基因突變，其中FAM135B是首次發(fā)現(xiàn)的腫瘤相關(guān)基因;同時獲得了食管鱗癌拷貝數(shù)變異的重要數(shù)據(jù)，發(fā)現(xiàn)位于染色體11q13.3-13.4擴增區(qū)域的MIR548K參與食管鱗癌的惡性表型的形成。這些基因突變和拷貝數(shù)的變異是食管癌發(fā)生發(fā)展的重要因素，與臨床食管癌患者的預(yù)后密切相關(guān)。

    該項研究還發(fā)現(xiàn)重要組蛋白調(diào)節(jié)基因MLL2、ASH1L、MLL3、SETD1B和CREBBP/EP300在食管鱗癌中呈現(xiàn)頻繁非沉默突變。研究人員對潛在治療靶點進行分析，發(fā)現(xiàn)PI3K是食管鱗癌突變頻率最高的潛在藥靶，以及PSMD2、RARRES1、SRC、GSK3β和SGK3等潛在新藥靶。研究人員整合了所有基因突變和基因拷貝變異數(shù)據(jù)，確定了與食管鱗癌發(fā)生發(fā)展相關(guān)的重要信號通路，包括Wnt、cellcycle、Notch、RTK-Ras和AKT通路。

    詹院士指出：“該研究是我國多個科研團隊通過協(xié)同創(chuàng)新的方式，結(jié)合國家在腫瘤防控領(lǐng)域的重大需求，針對具有我國特色的食管癌開展的一項科研工作。該研究從創(chuàng)新的視野和系統(tǒng)的層面，描繪了我國高發(fā)食管鱗癌基因組異常改變的全景。研究成果為了解食管鱗癌的發(fā)生發(fā)展機制提供了新思路，為研發(fā)特異性治療食管癌藥物，制定有效的臨床診斷和治療食管癌方法提供了科學(xué)依據(jù)。”