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基因組測序新技術(shù):快速簡便

2011-01-25 11:13 閱讀:1461 來源:《納米快報(bào)》 作者:水**南 責(zé)任編輯:水北天南
[導(dǎo)讀] 來自倫敦帝國理工學(xué)院的科學(xué)家正在開發(fā)一種技術(shù),它能夠在幾分鐘內(nèi)完成個(gè)人基因組的測序,且費(fèi)用比目前的技術(shù)要低得多

  來自倫敦帝國理工學(xué)院的科學(xué)家正在開發(fā)一種技術(shù),它能夠在幾分鐘內(nèi)完成個(gè)人基因組的測序,且費(fèi)用比目前的技術(shù)要低得多。研究人員已經(jīng)將這項(xiàng)原型技術(shù)申請專利,其研究成果發(fā)表在近期的《納米快報(bào)》(Nano Letters)雜志上。
  在這個(gè)新研究中,研究人員證明能在50nm孔中利用電荷高速推動(dòng)DNA鏈。當(dāng)DNA鏈出現(xiàn)在芯片后面時(shí),它的編碼序列被一種電極隧道接頭(tunnelling electrode junction,生物通譯)讀取。電線之間的2nm間隔支持一種電流,它能與每個(gè)堿基的不同電信號相互作用。然后,一臺(tái)強(qiáng)大的計(jì)算機(jī)能夠解析堿基的信號,以構(gòu)建出基因組序列。
  一直以來,因納米孔測序的高速和高通量,它被認(rèn)為是DNA測序技術(shù)的重大進(jìn)步。在典型的納米孔實(shí)驗(yàn)中,生物分子在電力驅(qū)動(dòng)下穿過一個(gè)外加電場的納米孔。這導(dǎo)致孔內(nèi)離子電流的特征性阻斷。通過分析,能提取出有關(guān)分子性質(zhì)的一些信息,如長度、成分以及與其他分子的相互作用。但是,目前基于粒子電流阻斷或熒光的檢測似乎還缺乏時(shí)空的分辨率,不能獲得結(jié)構(gòu)信息。
  而另一種基于DNA的隧道運(yùn)輸?shù)臋z測方法有望打破這些限制。因其源于量子力學(xué),隧道電流隨距離迅速衰減,從而提高空間分辨率,還提供了分子的特異性。
  帝國理工學(xué)院化學(xué)系的Emanuele Instuli博士解釋了研究時(shí)面臨的挑戰(zhàn):“直到現(xiàn)在還很難精確對齊接頭和納米孔。此外,對這種尺寸電線的改造接近原子規(guī)模,實(shí)際上已達(dá)現(xiàn)有儀器的極限。然而,在實(shí)驗(yàn)中,我們能夠讓兩個(gè)鉑電線進(jìn)入電極接頭,其間隔足夠小,讓電流能夠通過。”


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