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表觀遺傳調(diào)控在糖尿病及其并發(fā)癥中的作用

2014-04-25 13:30 閱讀:2906 來源:中華腎臟病雜志 責(zé)任編輯:潘樂樂
[導(dǎo)讀] 糖尿病(DM)是一種受多重復(fù)雜因素影響的慢性代謝性疾病,遺傳和環(huán)境因素的改變可導(dǎo)致DM 的發(fā)生。DM 常伴有大血管并發(fā)癥(如動(dòng)脈粥樣硬化、高血壓和中風(fēng))和微血管并發(fā)癥(如糖尿病腎病、視網(wǎng)膜病和神經(jīng)病變)。

    糖尿?。―M)是一種受多重復(fù)雜因素影響的慢性代謝性疾病,遺傳和環(huán)境因素的改變可導(dǎo)致DM 的發(fā)生。DM 常伴有大血管并發(fā)癥(如動(dòng)脈粥樣硬化、高血壓和中風(fēng))和微血管并發(fā)癥(如糖尿病腎病、視網(wǎng)膜病和神經(jīng)病變)。

    目前,DM 是繼心血管疾病和腫瘤之后的第三大非傳染性疾病,全球DM的流行給患者和社會帶來了沉重的經(jīng)濟(jì)負(fù)擔(dān)。近年雖然一些藥物可改善DM患者預(yù)后,但仍有很多患者出現(xiàn)糖尿病并發(fā)癥。

    目前已經(jīng)證實(shí),患者在確診DM之前就已經(jīng)出現(xiàn)糖耐量異常,機(jī)體隨之形成了代謝性記憶,為以后可能出現(xiàn)的DM相關(guān)性血管并發(fā)癥埋下隱患。同時(shí)也提示,表觀修飾異??赡芡ㄟ^影響代謝性記憶的發(fā)生而參與DM 及其并發(fā)癥的發(fā)病機(jī)制。

    目前表觀遺傳修飾包括:DNA 甲基化、組蛋白化學(xué)修飾、染色質(zhì)重塑和miRNA 4 種調(diào)控方式,筆者主要對其中的DNA甲基化、組蛋白化學(xué)修飾在DM及其腎臟并發(fā)癥中的研究進(jìn)展進(jìn)行綜述。

    一、表觀遺傳學(xué)的概述

    早在1942 年,康德拉?哈爾?沃丁頓就首次提出了表觀遺傳學(xué)(epigenetics)的概念,幾十年后,霍利迪針對表觀遺傳學(xué)提出了更新的系統(tǒng)性論斷,即表觀遺傳學(xué)是基因的DNA 序列不發(fā)生改變的情況下,基因的表達(dá)水平與功能發(fā)生改變,并產(chǎn)生可遺傳的表型。

    表觀遺傳對生物體各種類型細(xì)胞的生長和分化至關(guān)重要,然而隨著環(huán)境因素的影響或年齡的增長,細(xì)胞正常的表觀遺傳狀態(tài)也會被打破,這就使得表觀遺傳改變在一些復(fù)雜的多因素疾病,如糖尿病腎?。―N)的發(fā)病機(jī)制中發(fā)揮了重要作用。

    1. DNA 甲基化:

    DNA 甲基化是最基礎(chǔ)的基因表觀遺傳學(xué)修飾,不僅調(diào)節(jié)基因的表達(dá),而且對染色體保持穩(wěn)定起重要作用。在脊椎動(dòng)物中,DNA 甲基化主要發(fā)生在CpG 島。

    DNA 甲基化由DNA 甲基轉(zhuǎn)移酶家族(DNAmethyltransferases,DNMTs)催化,將甲基基團(tuán)合成到5'?CpG?3'中胞嘧啶的第五位碳原子上。盡管基因組大部分基因是非甲基化的,但是基因啟動(dòng)子區(qū)的CpG 島在成長過程中易發(fā)生動(dòng)態(tài)甲基化改變。

    通?;騿?dòng)子區(qū)域的CpG 島處于非甲基化狀態(tài),當(dāng)發(fā)生甲基化時(shí),可導(dǎo)致基因沉默的發(fā)生,而產(chǎn)生這一作用的機(jī)制可能與阻礙AP2、NF?κB、c?Myc和E2F等轉(zhuǎn)錄因子與啟動(dòng)子的結(jié)合、結(jié)合轉(zhuǎn)錄抑制因子(如甲基化結(jié)合蛋白)和改變?nèi)旧|(zhì)的結(jié)構(gòu)有關(guān)。

    2. 組蛋白化學(xué)修飾:

    組蛋白是染色體基本結(jié)構(gòu)核小體的重要組成部分,包括:組蛋白H1、H2(H2A 和H2B)、H3、H4和H5。組蛋白尾部(N端氨基酸殘基)可發(fā)生乙酰化、甲基化、磷酸化及泛素化等多種共價(jià)修飾作用,且這些修飾作用大多是可逆的。

    組蛋白化學(xué)修飾通過影響組蛋白與DNA 雙鏈的親和性,從而改變?nèi)旧|(zhì)的疏松或凝集狀態(tài),或通過影響轉(zhuǎn)錄因子與結(jié)構(gòu)基因啟動(dòng)子的親和性來發(fā)揮基因調(diào)控作用。

    組蛋白乙酰化(acetylation,Ac)修飾是一個(gè)快速動(dòng)態(tài)修飾的過程,主要是在組蛋白乙酰轉(zhuǎn)移酶(histoneacetyltransferase,HATs)和組蛋白去乙酰化酶(histonedeacetylases,HDACs)的協(xié)調(diào)作用下進(jìn)行的。

    HATs 催化組蛋白乙?;?,導(dǎo)致染色質(zhì)結(jié)構(gòu)松散,促進(jìn)基因轉(zhuǎn)錄;而HDACs使組蛋白去乙酰化,導(dǎo)致染色質(zhì)凝聚,抑制基因轉(zhuǎn)錄。組蛋白乙?;识鄻有?,核小體上有多個(gè)位點(diǎn)可提供乙?;囟ɑ虿课坏慕M蛋白乙?;腿ヒ阴;砸环N非隨機(jī)的、位置特異的方式進(jìn)行。

    組蛋白甲基化是指發(fā)生在組蛋白N 端精氨酸或賴氨酸殘基上的甲基化,由組蛋白甲基轉(zhuǎn)移酶(histonemethyltransferase,HMTs)和去甲基化酶(lysine demethylase,***)動(dòng)態(tài)調(diào)節(jié)。

    與組蛋白乙酰化不同,組蛋白甲基化更加穩(wěn)定和持久。根據(jù)組蛋白甲基化形式、甲基化位點(diǎn)和被修飾的氨基酸殘基類型的不同,組蛋白甲基化可導(dǎo)致轉(zhuǎn)錄的激活或抑制。如今,組蛋白修飾在表觀遺傳機(jī)制中起重要作用的觀點(diǎn),被越來越多的人認(rèn)同,但其具體的作用機(jī)制還沒有被完全認(rèn)識。

    Vaissiere 等發(fā)現(xiàn),CpG 島DNA 甲基化可促進(jìn)組蛋白去乙酰化,導(dǎo)致相關(guān)基因轉(zhuǎn)錄抑制,且其通過調(diào)節(jié)H3K9me3的組蛋白甲基轉(zhuǎn)移酶SUV39H1的募集可以進(jìn)一步增強(qiáng)轉(zhuǎn)錄抑制。反之,組蛋白乙?;梢酝ㄟ^抑制DNA 甲基轉(zhuǎn)移酶與CpG 島的結(jié)合來抑制DNA 甲基化。

    Murr 等發(fā)現(xiàn)DNA 甲基化及其它的組蛋白修飾之間也存在類似的相互作用。表觀遺傳機(jī)制間的相互作用使基因調(diào)控變得更加復(fù)雜,而它們在DM及其并發(fā)癥中的作用機(jī)制仍有待進(jìn)一步的研究。

    3. 表觀遺傳修飾與代謝性記憶:

    所謂“代謝性記憶”現(xiàn)象是指高糖介導(dǎo)的微血管病變即使在后續(xù)血糖控制達(dá)標(biāo)后仍可持續(xù)進(jìn)展。研究表明,代謝記憶的分子機(jī)制是糖尿病誘導(dǎo)的關(guān)鍵靶細(xì)胞中特定轉(zhuǎn)錄復(fù)合器在血糖恢復(fù)正常后仍持續(xù)啟動(dòng),介導(dǎo)后續(xù)核內(nèi)基因表達(dá)譜異常。

    相關(guān)研究提示即使不再存在環(huán)境因素**,組蛋白異常修飾及DNA 甲基化改變也不會恢復(fù),這種持久的改變可遺傳給后代。

    國外學(xué)者采用染色質(zhì)共沉淀?測序技術(shù)分析了高糖負(fù)荷條件下血管平滑肌細(xì)胞的表觀修飾模式,發(fā)現(xiàn)組蛋白H3K9、H3K14 呈高度乙酰化修飾,并參與了內(nèi)皮功能異常的發(fā)生。

    同時(shí)研究還發(fā)現(xiàn),預(yù)先進(jìn)行高糖培養(yǎng)的系膜細(xì)胞2 d 后再恢復(fù)正常糖濃度培養(yǎng)3、6、9 d,H3和H4 乙?;鞍姿饺暂^正常糖濃度組顯著上調(diào),與Zhong等在細(xì)胞和糖尿病大鼠記憶模型中的研究結(jié)果相似。以上結(jié)果表明高糖可誘導(dǎo)靶細(xì)胞、染色質(zhì)組蛋白乙?;厮埽以撔?yīng)在血糖恢復(fù)正常后仍持續(xù)存在。

    有趣的是,即使短期的高血糖**也可以導(dǎo)致長期的表觀遺傳修飾的改變。El?Osta 等通過體外分離培養(yǎng)的上皮細(xì)胞實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),上皮細(xì)胞暴露于高糖環(huán)境16 h后,在正常糖濃度中培養(yǎng)若干天,其NF?κB、p65表達(dá)持續(xù)增加,同時(shí)啟動(dòng)子H3K4me1標(biāo)志物表達(dá)持續(xù)增加,伴隨組蛋白甲基化酶SET7在p65啟動(dòng)子區(qū)募集增多。但上述這些改變可以被線粒體電子傳遞鏈阻礙復(fù)合體阻斷。

    總之,目前的研究均表明高糖可以導(dǎo)致靶細(xì)胞表觀遺傳改變,且即使血糖控制在正常水平時(shí),表觀遺傳改變?nèi)钥梢詫?dǎo)致DM 微血管及大血管并發(fā)癥發(fā)病相關(guān)基因持續(xù)表達(dá)。

    二、表觀遺傳調(diào)控在糖尿病及其并發(fā)癥發(fā)展中的作用

    1. DNA 甲基化與糖尿病及其并發(fā)癥:

    研究發(fā)現(xiàn)某些DNA 甲基化參與了DM 發(fā)生。例如DM 狀態(tài)下,轉(zhuǎn)錄輔助活化因子1α( PGC?1α)啟動(dòng)子區(qū)DNA 甲基化增加,而PGC?1α表達(dá)下降。

    由于PGC?1α與葡萄糖**胰島素的分泌呈正相關(guān),提示DNA甲基化修飾通過抑制PGC?1α表達(dá)導(dǎo)致糖尿病db/db 小鼠胰島素分泌減少。

    此外,全基因組研究表明,在高糖條件下細(xì)胞內(nèi)組蛋白DNA 甲基化存在明顯差異,且血管內(nèi)皮細(xì)胞炎性反應(yīng)基因啟動(dòng)子區(qū)的DNA 甲基化呈現(xiàn)長期持久的變化,提示表觀遺傳調(diào)控可能與糖尿病代謝機(jī)制有關(guān)。

    同樣在DN 和慢性腎臟病(CKD)患者中均發(fā)現(xiàn)有不同程度的DNA 甲基化。DNA 甲基化也受到與腎衰竭相關(guān)的尿毒癥成分的影響。研究表明,CKD 和終末期腎?。‥SRD)患者均可出現(xiàn)高同型半胱氨酸血癥,伴S腺苷同型半胱氨酸升高。

    同型半胱氨酸前體S?腺苷同型半胱氨酸是S?腺苷甲硫氨酸依賴的甲基轉(zhuǎn)移酶的強(qiáng)拮抗因子,同時(shí)也是導(dǎo)致DNA 甲基化改變的重要因子之一,在多種高同型半胱氨酸血癥性疾?。ò蚨景Y)中均顯著增高。

    事實(shí)上,血清中S?腺苷同型半胱氨酸水平升高在伴有血管疾病的CKD患者中已有報(bào)道。上述研究均提示DNA 甲基化異常可能通過影響啟動(dòng)子區(qū)域的基因結(jié)構(gòu)來參與CKD的發(fā)生發(fā)展。

    最新研究報(bào)告顯示,對唾液中提取的DNA 基因進(jìn)行甲基化水平測定,發(fā)現(xiàn)在糖尿病腎病(DN)不同發(fā)展階段,DNA 甲基化修飾存在顯著差異,并可識別糖尿病終末期腎病與無腎臟并發(fā)癥的糖尿病患者,兩組至少有兩個(gè)CpG 位點(diǎn)甲基化存在明顯差異。這表明DNA 甲基化水平差異可能在預(yù)測疾病易感性及疾病進(jìn)展方面起作用。

    2. 組蛋白修飾與糖尿病及其并發(fā)癥:

    目前研究表明組蛋白修飾在DM 及其并發(fā)癥中起重要作用。Miao 等發(fā)現(xiàn)體外分離培養(yǎng)高糖**的單核細(xì)胞及DM 患者外周血中的單核細(xì)胞內(nèi)TNF?α和COX?2 基因啟動(dòng)子上H3K9和H3K14Ac 水平增高,還發(fā)現(xiàn)HAT(pCAF)與NF?κB 信號通路的轉(zhuǎn)錄因子p65 結(jié)合能力增加且促進(jìn)了NF?κB 途徑的轉(zhuǎn)錄活性,提示DM時(shí)炎性反應(yīng)相關(guān)基因的過度表達(dá)與組蛋白過乙酰化反應(yīng)相關(guān)。

    Boekhoudt 等發(fā)現(xiàn)TNF?α誘導(dǎo)單核細(xì)胞趨化蛋白1(monocyte chemoattractant protein?1,MCP?1)基因啟動(dòng)子區(qū)發(fā)生高乙?;磻?yīng),增加Sp1和p65在該調(diào)控區(qū)的結(jié)合而促進(jìn)MCP?1基因表達(dá)。

    上述研究均表明組蛋白高乙?;揎椗c病理狀態(tài)下NF?κB信號通路的活化及下游調(diào)控基因的高表達(dá)密切相關(guān)。Reddy等還發(fā)現(xiàn)氯沙坦作用于體外高糖培養(yǎng)的腎小球系膜細(xì)胞時(shí),可部分逆轉(zhuǎn)其RAGE、血漿纖溶酶原活化因子抑制劑1(plasminogen activator inhibitor?1,PAI?1)及啟動(dòng)子MCP?1已經(jīng)增加的H3K9/14乙酰化水平,為糖尿病腎病提供了更加有效的靶向治療策略。

    Yuan等應(yīng)用體外分離培養(yǎng)的原代腎小球系膜細(xì)胞,以PAI?1 和P21 基因作為研究中心,觀察高糖及轉(zhuǎn)化生長因子β1(transforming growth factor β1,TGF?β1)**對細(xì)胞內(nèi)靶基因啟動(dòng)子區(qū)組蛋白乙?;揎椨绊懠癏AT/HADC 的表達(dá)變化,觀察與目標(biāo)基因表達(dá)密切相關(guān)的轉(zhuǎn)錄因子Smad2/3和Sp1蛋白乙酰化修飾的改變,以及這些化學(xué)修飾改變對靶基因轉(zhuǎn)錄水平的影響,并應(yīng)用糖尿病動(dòng)物模型,觀察高糖環(huán)境以及胰島素治療對腎小球內(nèi)乙?;揎?、基因表達(dá)以及腎小球肥大的影響。

    結(jié)果顯示,糖尿病大鼠肥大的腎小球及高糖環(huán)境下系膜細(xì)胞內(nèi)PAI?1 和p21 基因啟動(dòng)子上的組蛋白H3K9 及Smad2/3、Sp1 蛋白發(fā)生高乙?;揎?,提示高乙?;揎梾⑴cPAI?1 與p21 基因表達(dá)調(diào)控,并與糖尿病性腎小球肥大的發(fā)生有關(guān)。ECM的過度蓄積和腎小管上皮細(xì)胞上皮?間質(zhì)轉(zhuǎn)型有關(guān),是導(dǎo)致腎小球?yàn)V過率下降進(jìn)而出現(xiàn)腎功能損害的主要病理表現(xiàn)。

    有研究證明,HDACs特別是HDAC?2的活性在DN 模型db/db 小鼠體內(nèi)明顯增強(qiáng),在以TGF?β1 處理過的正常鼠腎小管上皮細(xì)胞中也有相同表現(xiàn),且HDACs 抑制劑能明顯減少ECM 成分基因的mRNA 和蛋白表達(dá),并能防止腎小管上皮細(xì)胞上皮?間質(zhì)轉(zhuǎn)型。

    這些研究表明HDACs 在腎臟纖維化和TGF?β1 致纖維化作用相關(guān)的DN等慢性腎臟損傷模型中發(fā)揮重要作用。

    Kaur 等研究發(fā)現(xiàn),作為體內(nèi)重要的HAT,p300 在高糖處理的內(nèi)皮細(xì)胞NF?κB 信號通路活化以及DM 相關(guān)的腎臟ECM 沉積中發(fā)揮重要作用。

    進(jìn)一步研究表明,高糖增加p300的表達(dá),導(dǎo)致血管內(nèi)皮細(xì)胞ECM基因和血管活性因子啟動(dòng)子區(qū)組蛋白乙?;黾?。有趣的是,在體外分離培養(yǎng)的人臍靜脈內(nèi)皮細(xì)胞實(shí)驗(yàn)中p300 抑制劑如姜黃素,能阻礙高糖誘導(dǎo)的糖尿病血管并發(fā)癥相關(guān)基因的表達(dá)。

    遺憾的是,在進(jìn)行小鼠實(shí)驗(yàn)時(shí)發(fā)現(xiàn),無論在誘導(dǎo)小鼠產(chǎn)生DM 之前或之后,進(jìn)食姜黃素均不能減少糖尿病小鼠蛋白尿。

    Francis 等采用小干擾RNA 表達(dá)的腺病毒載體轉(zhuǎn)染BTC3 細(xì)胞系,抑制PDX?1 基因表達(dá),發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)染細(xì)胞胰島素基因啟動(dòng)子鄰近區(qū)域的H3K4me2 水平也明顯下降,同時(shí)TNF?α誘導(dǎo)的NF?κB 依賴的炎性反應(yīng)基因,如MCP?1、TNF?α和IL?8 的表達(dá)也顯著減少。

    Li 等通過體外分離培養(yǎng)的人THP?1單核細(xì)胞和HEK293細(xì)胞系實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),高糖**時(shí),內(nèi)皮細(xì)胞內(nèi)Set7/9 表達(dá)增多,其活化的NF?κB的表達(dá)也增多。

    沉默Set7/9 也能減少NF?κB 途徑P65 亞單位和p300 募集到MCP?1和TNF?α啟動(dòng)子上,同時(shí)MCP?1和TNF?α啟動(dòng)子上的H3K4me相應(yīng)減少。

    這些結(jié)果提示,Set7/9也許通過啟動(dòng)子H3K4 甲基化修飾來共激活NF?κB的轉(zhuǎn)錄,從而對糖尿病環(huán)境下的炎性反應(yīng)**物作出反應(yīng)。

    Sun 等發(fā)現(xiàn)采用siRNA 沉默SET7/9 基因,能顯著減少TGF?β1 誘導(dǎo)的ECM 相關(guān)基因表達(dá),并且發(fā)現(xiàn)TGF?β1抗體不僅能阻礙高糖誘導(dǎo)的ECM 基因的表達(dá),而且可逆轉(zhuǎn)高糖**時(shí)ECM 相關(guān)基因啟動(dòng)子上H3K4me 的水平及SET7/9的募集。

    Keating等發(fā)現(xiàn),SET7/9組蛋白甲基轉(zhuǎn)移酶是調(diào)節(jié)組蛋白及非組蛋白賴氨酸殘端甲基化作用的關(guān)鍵酶。因此,Set7/9 也許是控制包括DM 在內(nèi)的炎性反應(yīng)性疾病的一個(gè)新的治療靶標(biāo)。

    還有研究發(fā)現(xiàn),db/db 小鼠的血管平滑肌細(xì)胞中SUV39H1 蛋白水平降低,同時(shí)IL?6和MCP?1 啟動(dòng)子上的H3K9me3 相應(yīng)減少。

    因此,在炎性基因啟動(dòng)子中,SUV39H1或其介導(dǎo)的H3K9me3的減少,可能導(dǎo)致抑制性蛋白的丟失,從而使各種炎性基因過度表達(dá),最終導(dǎo)致DM患者的血管病變。

    綜上,特定的靶基因啟動(dòng)子的表觀遺傳改變也許可以解釋糖尿病腎臟及其它并發(fā)癥的快速進(jìn)展,以及即使在藥物治療或血糖水平已經(jīng)控制時(shí)仍存在持續(xù)性代謝記憶的發(fā)生。

    三、總結(jié)

    表觀遺傳在疾病的發(fā)生和發(fā)展中起著十分重要的作用。研究表明高糖**可使基因發(fā)生表觀遺傳改變,如DNA甲基化、組蛋白乙?;⑷旧|(zhì)重塑及microRNAs,從而來調(diào)節(jié)細(xì)胞內(nèi)炎性反應(yīng)基因及纖維化基因表達(dá)相關(guān)的信號傳導(dǎo)通路,最終使靶細(xì)胞主要的炎性反應(yīng)及纖維化基因表達(dá)失調(diào)。

    這種持續(xù)的表觀遺傳改變也許是代謝記憶的重要機(jī)制。但是,各種表觀遺傳修飾如何作用于復(fù)雜的細(xì)胞循環(huán)途徑仍不十分清楚。不同于不可逆的基因序列改變,表觀遺傳修飾通常是可逆的,這為人們通過藥物干預(yù)病理狀態(tài)下表觀遺傳修飾提供了可能性。

    高通量測序技術(shù)的快速出現(xiàn)和進(jìn)展,便于集中研究DM及其并發(fā)癥的表觀遺傳,必將為DM及其并發(fā)癥的發(fā)病機(jī)制及防止策略帶來新的思路和機(jī)遇。


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