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Nature:人類疾病與遺傳變異研究指南

2014-04-24 12:14 閱讀:895 來源:愛愛醫(yī) 責(zé)任編輯:潘樂樂
[導(dǎo)讀] 測序人類全基因組比以往任何時(shí)候變得更快速、更便宜,使得比較患者與無特定疾病人群基因組一類的研究激增。臨床醫(yī)生和從事某種疾病遺傳貢獻(xiàn)研究的研究人員往往會(huì)遇到一些似乎與疾病相關(guān)的變異,但卻發(fā)現(xiàn)另外一些攜帶相同突變的人群并不罹患這種疾病或影響程度

    測序人類全基因組比以往任何時(shí)候變得更快速、更便宜,使得比較患者與無特定疾病人群基因組一類的研究激增。臨床醫(yī)生和從事某種疾病遺傳貢獻(xiàn)研究的研究人員往往會(huì)遇到一些似乎與疾病相關(guān)的變異,但卻發(fā)現(xiàn)另外一些攜帶相同突變的人群并不罹患這種疾病或影響程度較輕。

    醫(yī)生要怎樣找到真正引起疾病的遺傳變化?發(fā)表在周四《自然》(Nature)雜志上的一篇開放獲取論文為從事罕見遺傳變異效應(yīng)研究的研究人員提出了一些指導(dǎo)準(zhǔn)則。這些建議的焦點(diǎn)集中于幾個(gè)關(guān)鍵的領(lǐng)域,例如研究設(shè)計(jì),基因水平和變異水平上的意義、數(shù)據(jù)庫以及對(duì)于診斷的意義。

    論文共同作者、埃默里大學(xué) Marcus 自閉癥中心副主任、兒科副教授 Chris Gunter 博士是 2012 領(lǐng)先基因組研究人員研討會(huì)的組織者之一。這一由美國國家人類基因組研究所發(fā)起的研討會(huì)促成了這篇文章。

    “我們中有幾個(gè)人注意到,一些研究發(fā)布了有關(guān)特異序列與疾病之間關(guān)系的錯(cuò)誤結(jié)論,我們非常擔(dān)心這將轉(zhuǎn)化為不恰當(dāng)?shù)呐R床決策。”

    Gunter 說,醫(yī)生有可能基于一些錯(cuò)誤的結(jié)果來制定測試或治療,而它們并沒有真正得到一種遺傳變異與疾病之間的關(guān)聯(lián)支持。這篇文章可能有助于避免這樣的不恰當(dāng)決策。

    由 27 名研究人員組成的這一研究小組提出了兩個(gè)步驟來確定一種遺傳變異引起了疾?。簩?duì)來自于所有資源、支持該變異在特定疾病或狀況下起作用的證據(jù)進(jìn)行評(píng)估后,再進(jìn)行詳細(xì)的統(tǒng)計(jì)分析。此外,他們強(qiáng)調(diào)要優(yōu)先考慮科研技術(shù)和基礎(chǔ)設(shè)施開發(fā),包括鼓勵(lì)研究人員共享遺傳和臨床數(shù)據(jù)。

    文章中引用了一個(gè)與自閉癥相關(guān)的實(shí)例。研究人員在比較有無自閉癥個(gè)體的基因組時(shí)在 TTN 基因中發(fā)現(xiàn)了 4 個(gè)***的變異。 TTN 基因編碼了已知最大的一種肌蛋白(titin);相比其他基因的變異, TTN 基因變異有可能只是在它的邊界內(nèi)。不進(jìn)行適當(dāng)?shù)慕y(tǒng)計(jì)學(xué)校正,研究人員有可能會(huì)得出錯(cuò)誤的結(jié)論,認(rèn)為在自閉癥研究中值得進(jìn)一步地調(diào)查 TTN 。

    作者們指出,許多的 DNA 變異“有可能顯示一個(gè)潛在令人信服的故事:這一變異有可能是如何影響性狀的,但很少突變真正具有因果效應(yīng)。因此,利用諸如這篇Nature文章中這樣的基于證據(jù)的指導(dǎo)準(zhǔn)則至關(guān)重要。

    “我們相信對(duì)于其他領(lǐng)域想從事人類基因組研究、需要一個(gè)確定起點(diǎn)來調(diào)查遺傳效應(yīng)的科學(xué)家和臨床醫(yī)生們,這些指導(dǎo)準(zhǔn)則將尤為有用,” Gunter 說。


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