膀胱癌發(fā)病率居泌尿系統(tǒng)惡性腫瘤的首位,而在西方國(guó)家其發(fā)病率僅次于前列腺癌,居第2位.膀胱移行細(xì)胞癌(TCC)是膀胱癌中最常見(jiàn)的組織學(xué)類(lèi)型,男性發(fā)病率約為女性的3~4倍,多發(fā)生于40-70歲之間.目前,中國(guó)男性膀胱癌的年發(fā)病率已達(dá)十萬(wàn)分之八,并呈逐年上升的趨勢(shì).對(duì)于這一重要癌癥,目前卻沒(méi)有充足的基因組學(xué)數(shù)據(jù)供科研人員開(kāi)發(fā)新的治療方法以攻克膀胱癌.

 

    來(lái)自華大基因和市二院的科研人員對(duì)99個(gè)膀胱癌患者的組織樣本進(jìn)行了全基因組測(cè)序和全外顯子測(cè)序,共發(fā)現(xiàn)13個(gè)重要的新突變基因和24個(gè)已知突變基因如TP53,HRAS, FGFR3,PIK3CA以及KRAS等.在所發(fā)現(xiàn)的新突變基因中,位于X染色體上的STAG2基因顯得尤為特別,該基因與SCCS過(guò)程息息相關(guān).科研人員發(fā)現(xiàn)STAG2基因發(fā)生了高頻非同義突變,并且11個(gè)發(fā)生該基因突變的樣品中有9個(gè)都是終止突變.此外,與SCCS相關(guān)的ESPL1基因也發(fā)生了高頻突變.

 

    研究人員還通過(guò)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序?qū)?2對(duì)組織樣品進(jìn)行了研究,結(jié)果發(fā)現(xiàn)有32個(gè)潛在的基因重排可能會(huì)導(dǎo)致基因融合,并證實(shí)FGFR3和TACC3基因發(fā)生了融合.研究還發(fā)現(xiàn),TACC3的高表達(dá)不是TACC3基因自身的擴(kuò)增導(dǎo)致的,而是通過(guò)FGFR3這個(gè)轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子來(lái)調(diào)節(jié)的.

 

    此外,研究結(jié)果顯示染色體的非整倍體性及不穩(wěn)定性與膀胱癌發(fā)生有關(guān),并使膀胱癌成為首個(gè)擁有SCCS相關(guān)基因突變的癌癥.此外,本研究為膀胱移行細(xì)胞瘤提供了更全面綜合的基因組突變信息,并證明基因突變可影響SCCS過(guò)程,同時(shí)為膀胱癌的診斷治療提供了一種新的可能性.

 

    華大基應(yīng)該項(xiàng)目負(fù)責(zé)人陳超指出:"在這次研究中,我們發(fā)現(xiàn)了多個(gè)與SCCS相關(guān)的突變,包括STAG2、ESPL1基因的高頻突變以及FGFR3-TACC3基因融合.這一發(fā)現(xiàn)證實(shí)SCCS相關(guān)基因突變確實(shí)與膀胱癌的發(fā)生有關(guān),極大地推動(dòng)了膀胱癌遺傳學(xué)研究,同時(shí)也為膀胱癌的診斷治療提供了新思路.此外,研究中所獲得的數(shù)據(jù)資源也為以后膀胱癌的深入研究奠定了重要的科研基礎(chǔ)."