最近，一項(xiàng)重建流感病毒進(jìn)化樹(shù)的最新研究，向傳統(tǒng)觀點(diǎn)發(fā)出了挑戰(zhàn)，并解開(kāi)了一些關(guān)于流感爆發(fā)歷史意義的奧秘。這項(xiàng)研究成果發(fā)表在2月16日的《自然》（Nature）雜志上，對(duì)“隨著時(shí)間的推移，流感病毒在不同宿主物種的進(jìn)化關(guān)系”提供了迄今為止最全面的分析。該研究除了剖析病毒如何以不同速率在不同宿主物種中的演變，還對(duì)幾個(gè)傳統(tǒng)觀點(diǎn)發(fā)出了挑戰(zhàn)，例如“病毒主要是從野生鳥(niǎo)類(lèi)單向傳播到馴養(yǎng)鳥(niǎo)類(lèi)”的觀點(diǎn)。同時(shí)，這項(xiàng)研究也有助于解決引起1918年幾次空前嚴(yán)重的流感大流行的病毒的起源。
 

    這項(xiàng)新研究可能會(huì)改變科學(xué)家和健康專(zhuān)家對(duì)于“流感病毒的歷史、遺傳上它如何隨時(shí)間變化，以及它如何在不同宿主物種之間跳躍”這些問(wèn)題的看法。這些研究結(jié)果可能對(duì)于“從人口健康風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估到疫苗發(fā)展”都會(huì)產(chǎn)生影響。

    美國(guó)亞利桑那大學(xué)的生態(tài)學(xué)和進(jìn)化生物學(xué)教授MichaelWorobey，與愛(ài)丁堡大學(xué)進(jìn)化生物學(xué)研究所的AndrewRambaut教授共同指導(dǎo)了這項(xiàng)研究。MichaelWorobey稱(chēng)：“現(xiàn)在，對(duì)于所有這些宿主——包括鳥(niǎo)類(lèi)、人類(lèi)、馬和豬——的病毒，我們都有非常清晰的系譜樹(shù)，并且一旦你有了一種病毒的系譜樹(shù)，就會(huì)改變它的演化。與以前一直使用的方法相比，我們開(kāi)發(fā)的方法能夠更好地解決真正的演化和歷史問(wèn)題。”

    Worobey解釋說(shuō)，如果你沒(méi)有考慮到“病毒以不同速率在每種宿主物種中演化“這個(gè)事實(shí)，那么，對(duì)于“大流行病毒何時(shí)和在哪里出現(xiàn)？”，你可能會(huì)得到荒謬的結(jié)果。他指出：“一旦你正確解決了這些病毒的進(jìn)化樹(shù)，所有事情就會(huì)更加合理。”他補(bǔ)充道，這項(xiàng)研究開(kāi)始于他的餐桌上。“在我面前有一堆打印的這些進(jìn)化樹(shù)，我開(kāi)始用女兒恰巧放在餐桌上的塑料尺來(lái)測(cè)量這些進(jìn)化樹(shù)分支的長(zhǎng)度。就像一棵真實(shí)的樹(shù)的樹(shù)枝一樣，你可以看到，進(jìn)化樹(shù)的分支在人類(lèi)、馬和鳥(niǎo)類(lèi)中具有不同的生長(zhǎng)速率。然后我就產(chǎn)生了一個(gè)模糊的想法，這可能對(duì)關(guān)于‘這些病毒來(lái)自哪里以及它們?nèi)绾芜M(jìn)化’的公共衛(wèi)生推論非常重要。”

    Worobey的老搭檔AndrewRambaut在電腦上實(shí)現(xiàn)了他用塑料尺所做的事情。他們開(kāi)發(fā)了一種軟件可讓時(shí)鐘在不同速率不同宿主物種上發(fā)出滴答聲。一旦有了這個(gè)軟件，就會(huì)產(chǎn)生非常清楚和明確的結(jié)果。

    研究小組分析了一個(gè)數(shù)據(jù)集（包含代表甲型流感病毒全部多樣性的80,000個(gè)以上基因序列），并用他們最新開(kāi)發(fā)的方法分析了這些數(shù)據(jù)。甲型流感病毒分為17個(gè)所謂的HA亞型（HI到H17）和10個(gè)NA亞型（N1到N10）。這些亞型會(huì)混合搭配，例如H1N1、H7N9，在鳥(niǎo)類(lèi)中具有最大的多樣性。

    利用新的流感病毒系譜樹(shù)作為地圖，能夠顯示哪個(gè)物種在何時(shí)移動(dòng)到哪個(gè)宿主物種。這表明對(duì)于幾個(gè)基因組片段來(lái)說(shuō)，禽流感病毒遠(yuǎn)非我們經(jīng)常假設(shè)的那樣古老。研究人員發(fā)現(xiàn)，禽流感病毒在大多數(shù)基因中都有一段極短的歷史，比電話的發(fā)明早不了多少時(shí)間。

    該研究小組包括亞利桑那大學(xué)的研究生Guan-ZhuHan，愛(ài)丁堡大學(xué)教授、同時(shí)也隸屬于美國(guó)**衛(wèi)生研究院的AndrewRambaut。他們?cè)跀?shù)據(jù)中發(fā)現(xiàn)有強(qiáng)大的信號(hào)表明，在禽流感病毒中發(fā)生了一些***性事件，其大多數(shù)遺傳多樣性正被一些新變體取代。

    Worobey稱(chēng)，流感病毒進(jìn)化過(guò)程中的突然轉(zhuǎn)變，與十九世紀(jì)末的幾次歷史事件有關(guān)。“在19世紀(jì)70年代，一場(chǎng)巨大的馬流感疫情席卷北美。從城市到城市，鄉(xiāng)村到鄉(xiāng)村，馬都染病并且大約有5%的死亡率。在疫情爆發(fā)期間，因?yàn)闆](méi)有馬拉動(dòng)抽水機(jī)貨車(chē)，波士頓有一半城區(qū)被大火燒毀。除此之外，在西方，因?yàn)樗械鸟R都染上疫情，美國(guó)騎兵只能徒步與阿帕奇人戰(zhàn)斗。這發(fā)生在馬力為實(shí)效功率的時(shí)代，馬流感疫情對(duì)經(jīng)濟(jì)來(lái)說(shuō)無(wú)異于釜底抽薪。”

    據(jù)Worobey介紹，新生成的進(jìn)化樹(shù)表明，馬流感集中爆發(fā)的同時(shí)，也有禽流感病毒基因的總體更換。該研究還揭示，馬流感病毒與禽流感病毒具有最近的親緣關(guān)系。他說(shuō)：“有趣的是，以前的一項(xiàng)研究報(bào)告稱(chēng)，在馬流感爆發(fā)后的幾天里，在雞和其它家禽中也反復(fù)發(fā)生了流感疫情。這是歷史上另一種意想不到的聯(lián)系，鑒于我們?cè)谶M(jìn)化樹(shù)中所看到的，有一種可能性就是，這兩個(gè)事件有關(guān)聯(lián)。”

    他補(bǔ)充說(shuō)，進(jìn)化結(jié)果不能最終確定病毒是否從馬跳躍到鳥(niǎo)類(lèi)，或相反，但很明顯，這兩種病毒之間具有密切的關(guān)系。

    至于人類(lèi)，這項(xiàng)研究闡明了一個(gè)長(zhǎng)期存在的奧秘。自1918年的流感大流行以來(lái)，已不可能將大流行病毒的任何基因的地理起源，縮小到即便一個(gè)半球的范圍。Worobey指出他們的研究改變了這一點(diǎn)。

    目前公認(rèn)的觀點(diǎn)是：野生鳥(niǎo)類(lèi)是流感病毒的主要攜帶者，病毒從它們身上跳躍到馴化鳥(niǎo)類(lèi)和其它物種（包括人類(lèi)）中，研究結(jié)果對(duì)這個(gè)觀點(diǎn)發(fā)出了挑戰(zhàn)。研究人員指出，相反，馴化鳥(niǎo)類(lèi)和野生鳥(niǎo)類(lèi)禽流感病毒的整個(gè)基因庫(kù)的遺傳多樣性，經(jīng)常被追溯到更早出現(xiàn)的馴化鳥(niǎo)類(lèi)的病毒爆發(fā)。

    Worobey最后指出：“人們往往認(rèn)為野生鳥(niǎo)類(lèi)是一切病毒的來(lái)源，但是我們明確看到馴化鳥(niǎo)類(lèi)對(duì)野生鳥(niǎo)類(lèi)具有明顯的影響。原來(lái)我們一直食用和食蛋的動(dòng)物，可能在很大程度上塑造了這些病毒隨幾十年時(shí)間跨度在野生動(dòng)物中的多樣性。”