作為“癌癥基因組圖譜”之Pan-Cancer項目的一部分，本文作者發(fā)表了對來自超過3000個腫瘤、代表12個腫瘤類型的點突變和小“得失位”所做的數(shù)據(jù)分析。他們的發(fā)現(xiàn)包括127個顯著突變的基因，它們來自與癌癥有已經(jīng)確定的聯(lián)系和新發(fā)現(xiàn)聯(lián)系的細胞過程。他們還發(fā)現(xiàn)，腫瘤形成所需的驅(qū)動突變的數(shù)量是相對較小的。進一步的分析還識別出了對存活有顯著影響的基因以及腫瘤發(fā)生過程中的突變事件的可能時間順序。

    來自華盛頓大學醫(yī)學院的科學家們通過檢測12種主要的癌癥類型，鑒別出了127個似乎驅(qū)動了機體眾多腫瘤發(fā)生與發(fā)展的多次突變基因。這一研究發(fā)現(xiàn)為設計出新的診斷工具及更個體化的癌癥治療創(chuàng)造了條件。相關論文發(fā)表在著名科學期刊《自然》（Nature）雜志上。

    論文的資深作者是華盛頓大學基因研究所的丁莉（Li Ding）博士，其早年畢業(yè)于復旦大學，是世界著名的基因科學家。近期湯森？路透（Thomson Reuter）旗下的ScienceWatch網(wǎng)站，通過分析論文的引用次數(shù)，篩選出了2012年度“最熱門的科學家“，全球有21位科學家入選，丁莉博士榜上有名。 新研究表明通常在某些癌癥中發(fā)生突變的一些基因，也存在于看似無關的腫瘤中。例如，一種在25%的白血病病例中發(fā)生突變的基因，也被發(fā)現(xiàn)存在于乳腺癌、直腸癌、頭頸部癌、腎癌、肺癌、卵巢癌和子宮癌中。

    基于這些研究結果，研究人員設想采用一種測試來檢測一組癌基因中的錯誤，最終有可能成為大多數(shù)癌癥標準診斷檢查的一個組成部分。這樣的檢測結果有可能會基于患者獨特的遺傳特征來指導治療決策。

    由于基因組測序的發(fā)展，科學家們能夠以比數(shù)年前更快的速度，更便宜的價格對癌細胞DNA展開分析，因而使得生成一些關于癌癥的新見解成為可能。盡管早期的基因組研究通常側重于個別腫瘤類型，當前的研究則是率先聚焦多種不同癌癥類型的研究之一。

    丁莉博士說：“這僅僅是一個開始。許多的腫瘤科醫(yī)生和科學家們都想知道，是否有可能能夠提出一個導致所有人類癌癥的癌基因完整清單。我認為我們正越來越接近它。”

    新研究分析了來自3，281個腫瘤的基因——這些腫瘤匯集了乳腺癌、子宮癌、頭頸部癌、結直腸癌、膀胱癌、腎癌、卵巢癌、肺癌、腦癌和血癌。除發(fā)現(xiàn)了不同癌癥中基因之間的一些共同聯(lián)系，研究人員還鑒別出了一些特定癌癥類型獨有的突變。

    檢測跨越許多不同癌癥類型的大量腫瘤，為研究人員提供了必要的統(tǒng)計效力來鑒別顯著突變基因。這些頻繁發(fā)生于某些癌癥，而在另一些癌癥中很少存在的遺傳錯誤，被認為對于癌癥生長極其重要。

    盡管腫瘤中突變基因的平均數(shù)量隨癌癥類型各異，大多數(shù)的腫瘤都只有2-6個驅(qū)動癌癥的基因突變。研究人員說，這或許就是為何癌癥如此常見的一個原因。“盡管體內(nèi)的細胞多年來不斷地累積新突變，將一個健康細胞轉(zhuǎn)變?yōu)榘┘毎麆t只需要重要驅(qū)動基因的少數(shù)幾個突變，”丁莉說。

    包括共同第一作者、華盛頓大學的Cyriac Kandoth博士和Michael McLellan，以及合作者、布朗大學的Benjamin Raphael博士在內(nèi)的科學家們，鑒別出了對于生存具有重要影響的基因。

    TP53，一種眾所周知的癌相關基因，其在不同的癌癥類型中最為常見。它被發(fā)現(xiàn)存在于42%的樣本，尤其是在腎癌、頭頸部癌和急性髓細胞性白血病中，與不良預后相關。

    另一個基因BAP1也與不良預后有關，特別是在腎癌和子宮癌患者中。

    而乳腺癌基因BRCA2突變則與卵巢癌生存率增高相關，IDH1錯誤與一種尤其具侵襲性的腦瘤——成膠質(zhì)細胞瘤及其他的癌癥類型預后改善相關。

    華盛頓大學基因組研究所目前正在開展一項尋找其他癌基因的研究。制定出一張更全面的癌基因列表有可能為改善癌癥診斷，指導治療決策提供支持。

    “由于我們現(xiàn)在知道，例如在白血病中突變的基因也可以在乳腺癌中發(fā)生改變，肺癌中的遺傳錯誤也可以出現(xiàn)在結直腸癌中，我們認為開發(fā)出一種納入所有的癌基因的診斷測試將是完美的。這將能夠為我們提供更為完整的腫瘤發(fā)生事件圖像，并且可以利用這些信息來制定治療決策，”丁莉說。