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中美科學家成功繪制大鼠轉錄組圖譜

2014-02-14 11:18 閱讀:1041 來源:醫(yī)學論壇網 責任編輯:林曉楓
[導讀] 中美科研人員利用高通量序列測定來測序和定量RNA進行轉錄組分析的方法,對來自幼年、青春期、成年及老年的雌雄且具有正常免疫功能的Fischer344大鼠、涵蓋11種器官和4個發(fā)育階段的大鼠320個樣本進行了RNA測序,由此構建出了一張綜合大鼠轉錄組圖譜,繪制出400

    中美科研人員利用高通量序列測定來測序和定量RNA進行轉錄組分析的方法,對來自幼年、青春期、成年及老年的雌雄且具有正常免疫功能的Fischer344大鼠、涵蓋11種器官和4個發(fā)育階段的大鼠320個樣本進行了RNA測序,由此構建出了一張綜合大鼠轉錄組圖譜,繪制出40064個基因和65167種轉錄物表達譜。

    由復旦大學藥學院石樂明教授和美國洛馬林達大學CharlesWang博士作為共同通訊作者的反應該研究成果的論文,于2月10日發(fā)表在《自然·通訊》雜志上。專家認為,該大鼠轉錄組圖譜可與其他數據庫交聯,通過網絡獲取,為利用大鼠模型開展生物醫(yī)學研究提供了一個重要的資源。

    大鼠可用來開展藥物和化學毒性測試,評估潛在藥物效應機制,以及模擬人類疾病。利用RNA測序編寫出從出生到老年整個大鼠生命期以及兩性之間的轉錄組差異變化表,能夠提供關于疾病易感性、藥物療效與安全性、毒性機制的一些新認識,最終促使一些臨床前研究成果轉化應用于人類疾病防止。

    科研人員還發(fā)現了一些器官富集、差異性表達的基因,反映出已知的器官特異性生物活性。大量的轉錄物還顯示出器官特異性、年齡依賴性或性別特異性的差異表達模式。


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