根據(jù)近期發(fā)表在《新英格蘭醫(yī)學(xué)雜志》上的一篇文章，芯片能夠比傳統(tǒng)的核型分析提供更多臨床上相關(guān)的信息，從而有望成為產(chǎn)前診斷的標(biāo)準(zhǔn)方法。

    這項(xiàng)研究是由哥倫比亞大學(xué)醫(yī)學(xué)中心領(lǐng)導(dǎo)的，埃默里大學(xué)、Baylor醫(yī)學(xué)院和Signature Genomics也參與了研究工作。他們的主要目標(biāo)是與傳統(tǒng)的核型分析相比較，評估芯片分析的準(zhǔn)確性、有效性和潛在優(yōu)勢。他們的次要目標(biāo)是評估分析性能。自上世紀(jì)70年代起，核型分析就成為了產(chǎn)前診斷的標(biāo)準(zhǔn)方法。

    在四年的時(shí)間里，研究人員利用Affymetrix和安捷倫制造的芯片以及核型分析，對4,400名患者開展了試驗(yàn)。他們從高齡產(chǎn)婦中收集了羊水，并對胎兒進(jìn)行早期篩查，了解唐氏綜合征的風(fēng)險(xiǎn)是否升高，并通過超聲波檢查結(jié)構(gòu)異常，以及其他問題。所有樣品被送到一個(gè)參考實(shí)驗(yàn)室，開展染色體分析。所有數(shù)據(jù)提交到NCBI，對公眾免費(fèi)開放。

    研究人員發(fā)現(xiàn)，基于芯片的分析與核型分析一樣，能夠識別常見的非整倍體（即染色體數(shù)目異常），這會導(dǎo)致唐氏綜合征（21三體）和愛德華茲綜合征（18三體）等疾病。此外，對于超聲波檢查到生長或結(jié)構(gòu)異常的胎兒，芯片能夠在6%的病例中檢測到臨床相關(guān)的染色體缺失或重復(fù)，而核型分析并未檢測到。另外，對于高齡產(chǎn)婦或篩查結(jié)果呈陽性的病例，芯片技術(shù)能夠發(fā)現(xiàn)1.7%的異常（即每60個(gè)孕婦中的1個(gè)），而她們有著正常的核型。

    根據(jù)這些結(jié)果，第一作者Ronald Wapner認(rèn)為，芯片將取代核型分析，成為評估胎兒染色體異常的標(biāo)準(zhǔn)方法，并認(rèn)為芯片所發(fā)現(xiàn)的染色體微缺失和微擴(kuò)增也常常伴隨著嚴(yán)重的臨床問題。Wapner是哥倫比亞大學(xué)醫(yī)學(xué)中心婦產(chǎn)科的教授。

    據(jù)安捷倫公司介紹，該公司的芯片和試劑在研究中發(fā)揮了重要作用。71%的樣品是在安捷倫的SurePrint CGH芯片上運(yùn)行的，而數(shù)據(jù)分析時(shí)也用了安捷倫的軟件。安捷倫還協(xié)助研究人員開發(fā)了定制芯片。研究總共使用了5,500塊芯片。目前，芯片分析所使用的樣品需要通過侵入手段獲得胎兒細(xì)胞，如羊水穿刺或絨毛取樣。Wapner認(rèn)為，一旦有了非侵入性方法來檢測胎兒的遺傳性異常，所有孕婦都應(yīng)該進(jìn)行芯片分析，而不只是那些高風(fēng)險(xiǎn)孕婦。

    Wapner也在文中提到，隨著胎兒的全基因組測序在臨床上變得可行，從芯片分析中吸取的經(jīng)驗(yàn)教訓(xùn)也會有所幫助，將有助于確保新技術(shù)的合理應(yīng)用。目前一些公司已經(jīng)推出了基于測序的檢測，來實(shí)現(xiàn)非整倍體的非侵入性產(chǎn)前診斷，包括Sequenom、Ariosa Diagnostics和Verinata Health。

    美國醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)協(xié)會在兩年前更新了其指引，建議將芯片作為第一輪產(chǎn)后評估檢測，來診斷那些患有發(fā)育遲緩或智力障礙、自閉癥或多種先天性異常的患者。然而，在產(chǎn)前背景下，該機(jī)構(gòu)仍然認(rèn)為芯片應(yīng)當(dāng)作為核型分析的輔助檢測。

    盡管如此，目前有多家機(jī)構(gòu)和公司提供基于芯片的產(chǎn)前檢測。Baylor醫(yī)學(xué)院于2004年最先在美國推出基于芯片的產(chǎn)前檢測，而Signature Genomics（如今屬于PerkinElmer）和CombiMatrix也在近幾年推出類似的服務(wù)。