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美用DNA制出首個人造神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)

2011-08-10 10:31 閱讀:846 來源:科技日報 作者:q****e 責(zé)任編輯:qionghe
[導(dǎo)讀] 美國科學(xué)家朝人工智能領(lǐng)域邁出了關(guān)鍵的一步:他們使用DNA,在試管中制造出了首個人造神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),這個相互作用的分子組成的電路能像人腦一樣,基于不完整的模式進行回憶。

    DNA制成人造神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)
 

    美國科學(xué)家朝人工智能領(lǐng)域邁出了關(guān)鍵的一步:他們使用DNA,在試管中制造出了首個人造神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),這個相互作用的分子組成的電路能像人腦一樣,基于不完整的模式進行回憶??茖W(xué)家表示,這樣的系統(tǒng)將有助于人們回答基本的生物學(xué)問題或診斷疾病;然而,其運行效率目前還很低下,需要進一步提高其性能。

    DNA制成人造神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)

    該神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)包含4個人造神經(jīng)元,由112個不同的DNA片段組成。加州理工大學(xué)的科學(xué)家在一個名為線性閾函數(shù)的簡單的神經(jīng)模型上建立了該神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)。這個神經(jīng)元模型接收輸入信號,并通過一個正權(quán)數(shù)或負(fù)權(quán)數(shù)來增強每個信號,如果輸入信號的加權(quán)總和超過某個閾值,神經(jīng)元會放電,產(chǎn)生一個輸出信號。該研究的聯(lián)合作者、加州理工學(xué)院計算機科學(xué)和神經(jīng)系統(tǒng)副教授埃瑞克·溫弗利表示,這個模型是對真實神經(jīng)元的過度簡化,但其在探索一些簡單的計算元素的集體行為如何導(dǎo)致聯(lián)想回憶和模式完成等類似大腦的行為方面,確實非常有效。

    為了建成這個DNA神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),該團隊的科學(xué)家們使用了一個自行研發(fā)的、名為鏈置換級聯(lián)的過程,此前,該團隊也使用鏈置換級聯(lián)過程制造出了迄今最大最復(fù)雜、能計算平方根的DNA電路。

    這個過程使用了單鏈和雙鏈DNA分子的一部分。雙鏈DNA是雙螺旋結(jié)構(gòu),其中的一個鏈像尾巴一樣伸出,當(dāng)單鏈漂浮在水溶液表面時,可能會偶然遇見雙鏈DNA的一部分,如果兩者的堿基對完全互補,單鏈就會抓住雙鏈的尾巴并依附于其上,踢開雙螺旋的另一個單鏈。因此,這個單鏈就像輸入;而被踢開的雙鏈的一部分就像輸出,它接著可以同其他分子相互作用。因為科學(xué)家能使用任何堿基序列來合成DNA片段,因此,他們可以對這些相互作用編程讓其像神經(jīng)元模型一樣工作。

    可像人腦一樣基于部分特征識別事物

    隨后,科學(xué)家們同該神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)進行了一個“測心術(shù)”游戲:讓該神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)基于一定的線索確定4名科學(xué)家中的一位??茖W(xué)家們首先“訓(xùn)練”神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)“認(rèn)識”4名科學(xué)家,每名科學(xué)家的個性特征由4個是非題來表現(xiàn),例如,該科學(xué)家是否為英國人等等。通過使用計算機模擬讓該網(wǎng)絡(luò)中的每個DNA單鏈的濃度協(xié)調(diào)一致,科學(xué)家們能教導(dǎo)單鏈記住與每個科學(xué)家有關(guān)的是非題的答案模式。

    當(dāng)一個玩家想到某個科學(xué)家,就會向該神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)提出一些能部分展示該科學(xué)家特征的問題,接著通過將對這些問題作出反應(yīng)的DNA片段卸下放入試管中,從而將相關(guān)線索傳遞給神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)。通過熒光信號進行連接,該神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)能確切“說”出玩家想的是哪位科學(xué)家。

    科學(xué)家們使用了27種(總共有81種)不同的回答問題的方式同該神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)進行了這項游戲,網(wǎng)絡(luò)每次都作出了正確的反應(yīng)。該研究的聯(lián)合作者、加州理工大學(xué)計算和神經(jīng)系統(tǒng)以及電子工程學(xué)教授喬舒亞·布瑞克表示,這表明,該神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)能基于部分特征識別事物,這是大腦獨特的屬性之一。

    領(lǐng)導(dǎo)此項研究的加州理工學(xué)院生物工程專業(yè)博士后錢璐璐(音譯)在發(fā)表于7月21日出版的《自然》雜志上的論文中寫道:“這個人造‘大腦’可不簡單,它使得我們識別事物、形成記憶、做出決定并采取行動,這表明,一個由相互作用的分子組成的人造神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)也能展示與大腦一樣的行為。”

    在醫(yī)學(xué)和化學(xué)領(lǐng)域意義重大

    科學(xué)家們表示,具有人工智能或者擁有某些基本決策能力的生物化學(xué)系統(tǒng)在醫(yī)學(xué)、化學(xué)和生物學(xué)研究領(lǐng)域都具有非常重要的價值,未來,這樣的系統(tǒng)能在細(xì)胞內(nèi)操作,幫助回答基本的生物學(xué)問題或診斷疾病。另外,能對其他分子的出現(xiàn)作出智能反應(yīng)的生物化學(xué)過程使工程師能用分子制造出越來越復(fù)雜的化學(xué)物質(zhì)或者建立新的結(jié)構(gòu)。錢璐璐說:“盡管幾十年來,科學(xué)家們一直假設(shè),人造生物化學(xué)系統(tǒng)能表現(xiàn)出像大腦一樣的行為,但一直沒有實現(xiàn)。”

    這樣的系統(tǒng)也讓科學(xué)家可以間接理解智能的進化。錢璐璐解釋道:“大腦進化前,單細(xì)胞有機體也能處理信息、做決定并對周圍環(huán)境作出反應(yīng)。”這樣的復(fù)雜行為必須由一個漂浮在細(xì)胞內(nèi)的分子網(wǎng)絡(luò)完成,“或許高度進化的大腦和單細(xì)胞內(nèi)看到的有限的智能形式分享同樣的計算模式,只是采用不同的基質(zhì)來編程。”

    布瑞克補充道,他們的實驗可以看成神經(jīng)—計算原理在分子和細(xì)胞層面上的簡單展示,一個可能的解釋是,或許這樣的原理在生物信息處理領(lǐng)域隨處可見。

    需進一步改善其性能

    不過,科學(xué)家們也表示,盡管這個實驗表明科學(xué)家能用DNA制造出會閱讀思考的神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),但是,這個神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)還非常有限。人腦包含1000億個神經(jīng)元,但僅使用40個(實驗中使用的神經(jīng)元的10倍)由DNA制造出的神經(jīng)元來編織出一個網(wǎng)絡(luò)都是一個大的挑戰(zhàn)。而且,該系統(tǒng)的工作效率很低,其找出每個科學(xué)家需要花費8小時。另外,任務(wù)完成后,分子也被耗盡,無法分開并同另外的DNA單鏈配對,因此,該游戲只能進行一次。

    或許在未來,一個生物化學(xué)神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)能通過多次重復(fù)游戲來改進其性能;或通過遭遇新環(huán)境來學(xué)會新記憶。制造出能在身體內(nèi)或僅僅在細(xì)胞內(nèi)或一個有蓋培養(yǎng)皿內(nèi)操作的生物化學(xué)網(wǎng)絡(luò)還需要很長時間,因為使得這種技術(shù)能在試管內(nèi)工作也是另一個需要很大精力來應(yīng)對的挑戰(zhàn)。


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