生態(tài)微生物學與人體微生物學交叉
　　瑞爾曼和其他研究人員在過去5年里建立了人類微生物群落的遺傳目錄：哪種微生物生活在哪兒。數百種互相作用、互相促進的物種，生活在每個人的體表和體內，每個人的微生物群落之間還有重疊。
　　研究人員想知道在人體環(huán)境中，微生物在免疫功能、營養(yǎng)、藥物代謝方面，以及糖尿病、癌癥、孤獨癥和多倍體硬化癥等疾病中的作用。為了進行這些研究，他們必須進行大量的基因測序，分析群落里有哪些微生物，在一天之中它們如何變化，一生或飲食變化之后如何變化，某種微生物、微生物聯(lián)合以及微生物代謝物都有哪些功能等。
　　生態(tài)微生物學家給人類微生物界帶來了生態(tài)原則：殖民、繼承、回彈、兩個群體間的競爭與合作等。“科學問題確實存在交叉。”班菲爾德說：“比如殖民是指細菌首次到達居住地開始群體進化，這是一種生態(tài)上的連續(xù)性。當你看到一個酸礦廢水池塘的表面，想像一下最初的有機物種怎樣到達那里，同樣可以想象新生嬰兒，最初如何被細菌入侵的。”
　　生態(tài)微生物學家開始研究人類腸道、皮膚、口腔及其他微生物群落，他們已經走出了土壤、海洋、有毒廢場等環(huán)境微生物領域。
　　生態(tài)微生物原則離臨床應用尚有距離