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高通量基因產前篩查與診斷技術規(guī)范解讀

2015-03-04 19:45 閱讀:2501 來源:中國婦產科網 作者:學**涯 責任編輯:學海無涯
[導讀] 近日,國家衛(wèi)生計生委婦幼司委托中華醫(yī)學會、國家衛(wèi)生計生委臨床檢驗中心和產前診斷技術專家組評估確定的第一批高通量測序技術臨床應用試點單位名單公布,獲得開展遺傳病診斷、產前篩查與診斷、植入前胚胎遺傳學診斷3個專業(yè)的試點工作。

    近日,國家衛(wèi)生計生委婦幼司委托中華醫(yī)學會、國家衛(wèi)生計生委臨床檢驗中心和產前診斷技術專家組評估確定的第一批高通量測序技術臨床應用試點單位名單公布,獲得開展遺傳病診斷、產前篩查與診斷、植入前胚胎遺傳學診斷3個專業(yè)的試點工作。

    研究制定了《高通量基因測序產前篩查與診斷技術規(guī)范(試行)》。全國109家醫(yī)療機構獲批開展了基于第二代測序技術的無創(chuàng)產前基因檢測(noninvasive prenatal testing,NIPT)高通量測序試點工作。國家衛(wèi)生計生委婦幼司發(fā)布的《關于加強臨床使用基因檢測相關產品和技術管理的通知》(食藥監(jiān)辦械管[2014]25號)中,明確描述了試點單位的工作內容,具體包括:產前篩查與診斷前咨詢、適用范圍、知情同意書簽署、臨床資料收集和標本采集要求、檢測報告審核使用、檢測后臨床咨詢、高風險孕婦的后續(xù)臨床服務、追蹤隨訪、信息統(tǒng)計上報以及為規(guī)范開展高通量基因測序產前篩查與診斷臨床服務工作需要試點的其他相關內容。

    南方醫(yī)科大學南方醫(yī)院被選為首家獲得試點工作單位之一,該院產科鐘梅主任應邀接受本網站的采訪,就《高通量基因測序產前篩查與診斷技術規(guī)范(試行)》做出了專業(yè)解讀。

    1、無創(chuàng)產前檢查的定義

    根據獲取胎兒標本的不同方法來分類,產前檢查分為有創(chuàng)傷性和無創(chuàng)傷性兩種。目前,有創(chuàng)性產前診斷是診斷胎兒染色體疾病的金標準,主要是指通過絨毛活檢術、羊水穿刺術和臍靜脈穿刺術采集胎兒細胞或組織,來獲取胎兒染色體信息。有創(chuàng)檢測的準確率為98%-99%,但伴有0.5%-1%的流產風險,同時也會伴有羊水滲漏、宮內感染等風險,因此有創(chuàng)產前診斷目前僅應用于篩查高風險、高齡妊娠或家庭中生育過遺傳病患兒等情況。

    傳統(tǒng)的無創(chuàng)性產前檢查主要有超聲檢查和孕婦血清學檢測等方法,使用這些方法進行檢測可避免對胎兒和孕婦造成的危害,但是其靈敏度及特異性有限。近二十年來,基于超聲檢查和孕婦各種蛋白或激素的血清篩查相結合的產前篩查發(fā)展迅速。產前血清學篩查的目標疾病是21、18-三體綜合征和神經管缺陷,其在早孕期、中孕期、早結合中孕期的檢出率分別為83%、81%、94%-96%,假陽性率為5%左右,這些方法的假陽性率較高,為后續(xù)有創(chuàng)性產前診斷帶來較大的臨床壓力與實驗室壓力,帶來了一些不必要的穿刺。

    近年來,隨著新一代高通量測序技術的發(fā)展,出現(xiàn)了基于第二代測序技術的無創(chuàng)產前基因檢測(noninvasive prenatal testing,NIPT)技術,簡稱無創(chuàng)產前基因檢測。

    2、無創(chuàng)產前基因檢測如何定義?

    研究表明,整個孕期在孕婦的外周血中長期穩(wěn)定地存在著大量來自胎兒的游離DNA片段,大約孕7周后游離胎兒DNA以一定的比例穩(wěn)定存在于孕婦外周血中,并且隨著孕周的增大比例也而緩慢上升。

    只抽取孕婦的外周血,提取其中的游離胎兒DNA,采用新一代高通量測序技術,結合生物信息分析來檢測胎兒基因的技術,就是無創(chuàng)產前基因檢測技術。這樣有效避免了像絨毛活檢術、羊水穿刺術和臍靜脈穿刺術等有創(chuàng)檢查對胎兒和孕婦造成的危害。

    3、無創(chuàng)產前基因檢測能查什么疾病?

    目前在臨床上應用的,是針對染色體非整倍性疾病,主要是21-三體又稱唐氏綜合征,18-三體,13-三體3種疾病的產前檢測。

    處于研究階段的疾病有多種,像地中海貧血、假肥大性肌營養(yǎng)不良(DMD),血友病等。隨著測序深度的增加和生物信息學的發(fā)展,能夠應用于臨床檢測的疾病將會越來越多。

    4、NIPT 技術應用的目標疾病及技術定位有哪些?

    專家共識指出該技術在目前發(fā)展階段的目標疾病應該明確在胎兒21-三體、18-三體和13-三體綜合征,臨床應用宜定位于“近似于產前診斷水平的”、“目標疾病指向精確的”產前篩查技術。

    主要的理由有以下幾點:

    (1)。多個臨床研究結果已經充分證實了該技術用于21-三體、18-三體、13-三體產前篩查有良好的臨床有效性;(2)。這些研究中都存在21 -三體、18-三體、13- 三體和性染色體異常檢測的假陰性病例和檢測失敗的病例(2%-5%);(3)。這些研究提示,性染色體異常無創(chuàng)性診斷的符合率較低(約25%);(4)。從技術角度分析,雙胎或多胎、嵌合體及父母中存在染色體異常的病例均不適于進行NIPT分析,該部分病例約占所有病例的5%;(5)。該技術由于發(fā)展過程的局限性,現(xiàn)階段對于其他染色體三體異常、結構異常及微缺失綜合征尚缺乏有效的篩查指示作用。

    5、無創(chuàng)產前基因檢測優(yōu)勢有哪些?

    (1)。 傳統(tǒng)血清學篩查方法假陽性和漏檢風險均較高;新技術對于目標疾病存在高檢出率和低假陽性率。篩查孕周范圍大,可以應用于早孕期和中孕期,甚至孕23周以后。

    (2)。 無創(chuàng)產前基因診斷僅采集少量母血,提取其中的游離胎兒DNA進行檢測。所需信息少,取材便捷,流程較簡單,質量控制相對容易。技術有后續(xù)進一步發(fā)展的空間。

    (3)。 傳統(tǒng)產前診斷采用侵入性取樣方法,有感染、流產等風險;可以有效地降低后續(xù)侵入性產前診斷的數(shù)量,解決產前診斷技術力量不足的問題。

    6、無創(chuàng)產前基因檢測存在哪些局限?

    (1)。 篩查的目標疾病尚偏少,縮小了后續(xù)產前診斷的疾病范圍。

    (2)。 雙/多胎、嵌合體以及父母中存在染色體異常的病例均不適于進行該技術的篩查。

    (3)。 無創(chuàng)產前基因篩查仍無法取代有創(chuàng)的產前診斷檢查(假如無創(chuàng)檢測結果為陽性,仍需做羊水或臍血穿刺明確診斷)。

    7、無創(chuàng)產前基因檢測的準確性如何?

    該技術對目標疾病有高檢出率和低假陽性率。該技術對于21-三體等常見染色體非整倍體異常總體檢出率在99%以上,假陽性率在0.1%左右,大大優(yōu)于目前產前血清學篩查的效率。

    但是現(xiàn)在篩查的目標疾病僅為21-三體、18-三體、13-三體,而人有23對染色體,所以無法知道其他染色體的情況。有創(chuàng)性產前診斷仍然是診斷胎兒染色體疾病的金標準。

    8 、無創(chuàng)產前基因檢測適應人群?

    (1)。不能做有創(chuàng)產前診斷的孕婦,像有先兆流產、發(fā)熱、出血傾向、感染未愈等情況的孕婦;(2)。 產前篩查臨界高風險孕婦(如風險率在1/270-1/1000);(3)。高齡孕婦(年齡大于35歲)不合并其他染色體病高危因素時;(4)。珍貴兒妊娠,知情后拒絕介入性產前診斷的孕婦;(5)。對介入性產前診斷極度焦慮的孕婦;

    (6)。無法預約到產前診斷的孕婦。

    9 、哪些情況下不適合做無創(chuàng)產前基因檢測?

    (1)。產前B超檢查異常的孕婦;

    (2)。雙胎或多胎孕婦;

    (3)。夫婦之中任何一方有明確染色體結構或數(shù)目異常時;(4)。胎兒疑有微缺失綜合征、有其他染色體異常或基因病的孕婦;(5)。接受過異體輸血、移植手術、干細胞治療、免疫治療的孕婦。

    10、什么時候可以做無創(chuàng)產前基因檢測?

    在南方醫(yī)科大學南方醫(yī)院婦產科,懷孕9周-26周的孕婦均可抽血做無創(chuàng)產前基因篩查。

    11、做無創(chuàng)產前基因檢測前需要做哪些準備?

    帶齊化驗資料到醫(yī)院就診即可,本檢查不需要空腹,所以孕婦可以在飯后檢查。

    下面是南方醫(yī)院的基于第二代測序技術的無創(chuàng)產前基因檢測(noninvasive prenatal testing,NIPT)的數(shù)據: 2010-2014,5年共做1080例,共發(fā)現(xiàn)10例異常,21-三體8例,性染色體異常2例。最終通過羊水穿刺確診:21-三體8例,性染色體異常1例。有1例性染色體異常的為假陽性。無漏診情況。

    12 、高通量測序技術能夠應用于遺傳病的基因診斷嗎?

    目前的研究表明,應用高通量測序技術對單基因遺傳病家系的全基因組測序可以鑒定出致病突變。這樣對有眾多致病基因、遺傳異質性強的遺傳病也有可能做出高速及確切地基因診斷。另外,隨著測序費用的不斷下降及時間縮短,個人基因組測序可能會成為個性化醫(yī)療保健的基礎。

    13 、高通量測序技術能夠取代基因芯片嗎?

    高通量測序技術一次可獲得上百萬條、甚至幾百萬條序列信息,因此具有取代“基因芯片”技術的態(tài)勢。

    由于基因芯片的檢測范圍取決于芯片上探針的信息,因此只能檢測人們已知序列的特征,缺乏發(fā)現(xiàn)尋找新基因的能力,而高通量測序則能夠很好地彌補基因芯片這方面的不足。

    但就目前而言,高通量測序技術建立的時間還很短,技術不是很成熟,其信息儲備量也很有限;而基因芯片技術已經發(fā)展了20余年,其實驗技術及后期數(shù)據分析理論已經很成熟很完備,也積累了龐大的公共數(shù)據庫,因此短時間內基因芯片技術還會占據主導優(yōu)勢。但相信在不久的將來,高通量測序技術將會越來越成熟并得到更加廣泛的應用。

    高通量試點單位名單的公布為整個行業(yè)帶來了信心,意味著基因檢測產業(yè)將“有法可依”,整個行業(yè)秩序回歸理性與正常。對于罕見病家庭及有基因檢測需求的孕婦來說,從此有了檢測基因的正規(guī)渠道,可以幫助這類家庭規(guī)避遺傳風險,生育健康的下一代,這是一件利國利民的好事!


作者:李慧玲

    專家簡介:

    鐘梅教授,主任醫(yī)師,博士生導師,南方醫(yī)科大學南方醫(yī)院婦產科主任,全國婦產科醫(yī)師協(xié)會委員,廣東省圍產醫(yī)學分會副主委。從事婦產科臨床、科研及教學工作35年,有豐富的臨床經驗,擅長于高危妊娠的診治、孕產婦危急重癥搶救和產前診斷、遺傳咨詢等方面,尤其對地中海貧血、其他遺傳性疾病的產前早期診斷及防止有較深入的研究。
 


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