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全基因組測序發(fā)現(xiàn)肝癌基因突變

2013-07-03 14:08 閱讀:2176 來源:cmt.com.cn 作者:網(wǎng)* 責(zé)任編輯:網(wǎng)絡(luò)
[導(dǎo)讀] 由亞洲癌癥研究組織、中國深圳華大基因研究院等多家單位合作完成的與肝細(xì)胞癌相關(guān)的基因突變研究成果近日在《基因組研究》上發(fā)表。該研究為肝癌的分子診斷、治療及靶向藥物開發(fā)等奠定了重要的遺傳學(xué)基礎(chǔ)。

    肝細(xì)胞癌是目前最常見的一種肝癌,約占原發(fā)性肝癌的90%,我國更是該病的高發(fā)區(qū)之一。癌變本質(zhì)上講是由體細(xì)胞隨機(jī)積累起來的一些關(guān)鍵性基因組、轉(zhuǎn)錄組以及表觀遺傳變異所造成的。盡管當(dāng)前已有眾多肝細(xì)胞癌相關(guān)的研究,但由于技術(shù)和樣本量的限制,依然沒有發(fā)現(xiàn)明確具有普遍意義的基因突變。

    由亞洲癌癥研究組織、中國深圳華大基因研究院等多家單位合作完成的與肝細(xì)胞癌相關(guān)的基因突變研究成果近日在《基因組研究》上發(fā)表。該研究為肝癌的分子診斷、治療及靶向藥物開發(fā)等奠定了重要的遺傳學(xué)基礎(chǔ)。

    科研人員分別對88例肝細(xì)胞癌患者(其中81例HBV陽性和7例HBV陰性)的腫瘤組織和癌旁組織進(jìn)行了全基因組測序。他們通過對全基因組范圍內(nèi)的單堿基變異(SNV)、拷貝數(shù)變異(CNV)、插入缺失(Indel)、結(jié)構(gòu)變異(SV)以及HBV整合位點(diǎn)進(jìn)行檢測,發(fā)現(xiàn)了一系列與HBV介導(dǎo)的肝細(xì)胞癌發(fā)生、發(fā)展相關(guān)的基因突變及相關(guān)信號通路變化。他們將這些突變與臨床癥狀相聯(lián)系并進(jìn)行了全面分析,為肝細(xì)胞癌的診斷、治療提供了新思路。

    此外,科研人員還對肝細(xì)胞癌的3種亞型進(jìn)行了分子突變層面的歸類,同時,該研究還鑒定出一系列與肝細(xì)胞癌發(fā)生相關(guān)的基因,其中β-catenin基因是最易發(fā)生突變的致癌基因,TP53基因是最易發(fā)生的抑癌基因。


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